Dabartinė Salų bažnyčia pastatyta 1888 m., kunigo Kušleikos iniciatyva ir parėmus grafienei M. Pšezdeckienei. Tai architekto G. Vernerio projektas. Iki 1901 m. buvo pakabinti 2 varpai ir įrengti 3 altoriai. Per Pirmąjį pasaulinį kartą bažnyčia smarkiai nukentėjo, nugriauti bokšteliai, apgriautos sienos, skliautai. Bažnyčia remontuota 1939 m. ir po Antrojo pasaulinio karo.
Bažnyčia yra medinė, pastatyta iš tašytų eglinių rąstų ir apkalta lentomis. Ji pseudogotikos stiliaus, kryžiaus plano, vienbokštė. Viduje yra originalūs mediniai gotikinio stiliaus skliautai, trys altoriai. Šventoriaus tvora yra akmenų mūro su 3 mediniais vartais.