Strūnaičio Šv. Apaštalų Petro ir Povilo bažnyčia pastatyta 1847-1848 m. Bažnyčia sumūryta iš natūralių lauko akmenų, su skaldos mozaika ir baltai tinkuotais pagrindinio fasado piliastrais bei puskolonėmis. Ją projektavo Vilniaus universiteto architektas profesorius Karolis Gregotovičius, kurį laiką dirbęs Vilniaus gubernijos architektu.
Bažnyčios pastatas yra architektūros paminklas, turintis romantizmui būdingų klasicizmo bruožų. Bažnyčios statybą fundavo dvarininkas Konstantinas Mostovskis.