Šakališkės tipinis gatvinis kaimas, įsikūręs Aukštaitijos nacionaliniame parke, Žeimenos kairiajame krante. Archeologai nustatė, kad šiose vietose žmonių gyventa dar akmens amžiuje. Antrojo pasaulinio karo metais kaimas buvo beveik visas sudegintas.
Manoma, kad kaimas vadinamas Šakališkėmis, nes žmonės čia iš šakų statydavo būstus.
Už pusės kilometro nuo kaimo yra nutiestas geležinkelis.