Dabartinė Kačergiškės bažnyčia pastatyta 1993 m. koplyčios vietoje. Pirmoji koplyčia šioje vietoje buvo pastatyta 1743 m., 1783 m. perstatyta. 1988-1989 m. Kačergiškės bažnyčia buvo išardyta, o tai kas liko po ardymo - sudeginta.
Prie bažnyčios yra T. Patiejūno sukurtas koplytstulpis „Kristaus prisikėlimas“.